Le Produit Intérieur Brut a été calculé pour la premiere fois a Mayotte en 2005 en portant sur l'année 2001. Cette estimation a donné un PIB de 610 millions d'euros a prix courants en 2001. Avec une population qui était a cette époque de 154 000 habitants, cela ramenait le PIB par habitant a 3 960 euros, ce qui est cinq fois inférieur a celui des habitants de l'Europe des vingt-cinq et environ trois fois moins qu'a la Réunion. Ce PIB/Hbt est en revanche dix fois supérieur a celui des îles voisines des Comores.

Cette évaluation a également montré le poids prédominant du secteur public dans l'économie. La valeur ajoutée des administrations était en 2001 la premiere source de création de richesse a Mayotte. Avec 253 millions d'euros, elle en représentait 40 %.
La situation est inverse a celle de la Réunion, ou 40 % des valeurs ajoutées viennent du secteur "sociétés financieres et non financieres", alors qu'elle n'en créent que 30 % a Mayotte.